Förutom IFK Skövde spelade också 75 andra lag från 17 olika länder i Boys 16. De var uppdelade i 12 olika grupper, varav IFK Skövde började i Group 2 tillsammans med Mashrhino, GF Kroppskultur, Skånela IF, HBC Evergem and Lyon. IFK Skövde tog sig vidare till A-Play-off efter att ha hamnat på 2:a plats i Group 2. Därefter tog de sig till 1/16 Final, men förlorade den mot Tyresö Handboll med 16-22. I finalen slog Skanderborg HB HK Aranäs 1 och vann därmed hela A-Play-off i Boys 16. IFK Skövde deltog även i Boys 15 under Partille Cup 2016. Då tog de sig till 1/16 Final i A-Play-off, men förlorade den mot IR med 9-13.